Vụ Nội chính là đơn vị có nhiệm vụ giúp Bộ trưởng, Chủ nhiệm Văn phòng Chính phủ thực hiện chức năng tham mưu tổng hợp, điều phối giúp Chính phủ, Thủ tướng trong chỉ đạo, điều hành các lĩnh vực: quốc phòng, an ninh, trật tự an toàn xã hội; phòng, chống tội phạm, phòng cháy, chữa cháy, cứu nạn, cứu hộ; biên giới, công tác Biển Đông - Hải đảo; tìm kiếm cứu nạn; cơ yếu; địa giới đơn vị hành chính...
Đồng thời chủ trì theo dõi công tác phối hợp hoạt động giữa Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ với Toà án nhân dân tối cao, Viện kiểm sát nhân dân tối cao.
Theo dõi, tổng hợp tình hình công tác của Bộ Quốc phòng, Bộ Công an, Bộ Nội vụ (đối với lĩnh vực tín ngưỡng, tôn giáo; địa giới đơn vị hành chính), Bộ Ngoại giao (đối với lĩnh vực biên giới).
Lãnh đạo Vụ Nội chính hiện nay gồm: Ông Nguyễn Minh Khánh, Vụ trưởng và ba phó vụ trưởng là Khổng Ngọc Sơn, Đào Huy Du và Trần Thế Thông.