Một số gian hàng trong chợ đã trả mặt bằng để ngừng hoạt động.
Các hạng mục lớn khác cần cải tạo như hệ thống thoát nước, hệ thống cấp điện, thay mới hệ thống PCCC, lát nền với diện tích khoảng 10.000m2 có tổng kinh phí gần 45 tỷ đồng.
Phần nền tại các khu vực trong chợ sẽ được cải tạo, thay mới bằng loại gạch phù hợp và đồng bộ hơn. Hiện nay, gạch nền chợ bị bong tróc nhà nhiều và được chắp vá các kiểu gạch nền khác nhau gây mất thẩm mỹ.
Chợ Bến Thành được xây dựng năm 1912, đến năm 1985 chợ được trùng tu sửa chữa lần đầu.
Theo kế hoạch, phía trước chợ Bến Thành sẽ lát nền đá granite, xây dựng quảng trường, lắp tiện ích công cộng, phục dựng tượng Trần Nguyên Hãn, Quách Thị Trang... với kinh phí 157 tỷ đồng.