5. Ban Quản lý bồi dưỡng.
6. Ban Quản lý đào tạo.
7. Khoa Hành chính học.
8. Khoa Nhà nước và Pháp luật.
9. Khoa Quản lý xã hội.
10. Khoa Quản lý kinh tế.
11. Khoa Quản trị nhân lực.
12. Khoa Lưu trữ học và Quản trị văn phòng.
13. Khoa Khoa học liên ngành.
14. Khoa Ngoại ngữ - Tin học.
15. Viện Nghiên cứu khoa học hành chính.
16. Tạp chí Quản lý nhà nước.
17. Trung tâm Khảo thí và đảm bảo chất lượng đào tạo, bồi dưỡng.
18. Trung tâm Công nghệ và Thư viện.
19. Phân viện Học viện Hành chính Quốc gia tại Thành phố Hồ Chí Minh.
20. Phân viện Học viện Hành chính Quốc gia khu vực Miền Trung.
21. Phân viện Học viện Hành chính Quốc gia khu vực Tây Nguyên.
Ban Giám đốc Học viện gồm Giám đốc và không quá 4 Phó Giám đốc. Giám đốc Học viện do Bộ trưởng Bộ Nội vụ quyết định bổ nhiệm, miễn nhiệm sau khi có ý kiến của Thủ tướng Chính phủ. Các Phó Giám đốc Học viện do Bộ trưởng Bộ Nội vụ bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Giám đốc Học viện.