Đây là những đơn vị sự nghiệp công lập nằm trong hệ thống giáo dục và đào tạo của tỉnh Thanh Hoá, chịu sự quản lý của Sở Giáo dục và Đào tạo. Trường tự đảm bảo toàn bộ kinh phí chi thường xuyên, có tư cách pháp nhân, con dấu và tài khoản riêng theo quy định của pháp luật.
Lãnh đạo, cán bộ của các trường đều nằm trong tổng biên chế sự nghiệp của Đại học Hồng Đức được UBND tỉnh Thanh Hoá giao. Trường Tiểu học, Trung học cơ sở và Trung học Phổ thông - Đại học Hồng Đức có nhiều cấp học hiện hành và hoạt động theo điều lệ của Bộ Giáo dục và Đào tạo.