Theo Viện kiểm sát, Bộ Y tế đã kiểm tra giá hiệp thương, xác định Việt Á thay đổi nguyên vật liệu sản xuất nhưng không ra kết luận kiểm tra, không kiến nghị xử lý, dẫn đến Công ty Việt Á tiếp tục sử dụng mức giá trên, tạo mặt bằng giá để bán cho các đơn vị, địa phương.
Kết quả điều tra xác định trong năm 2020 và 2021 tổng doanh thu của Công ty Việt Á là hơn 4.247 tỷ đồng.
Trong đó, Công ty Việt Á đã sản xuất tổng hơn 8,7 triệu kit test, đã tiêu thụ cho các đơn vị, cơ sở y tế là hơn 8,3 triệu kit test với tổng giá trị hơn 3.929 tỷ đồng (giá 470.000 đồng/kit). Đã được thanh toán hơn 5.918.266 kit với tổng giá trị 2.257 tỷ đồng.
Như vậy, hành vi phạm tội của Phan Quốc Việt cùng nhóm cựu quan chức cấp cao đã gây thiệt hại hơn 432 tỷ đồng.
Ngoài ra, cơ quan tố tụng xác định Phan Quốc Việt đưa hối lộ với tổng số tiền 3 triệu USD và 4 tỷ đồng. Trong đó, đưa Nguyễn Thanh Long 2,25 triệu USD; Nguyễn Huỳnh (thư ký của ông Long) 4 tỷ đồng; Nguyễn Minh Tuấn (cựu vụ trưởng Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế Bộ Y tế) 300.000 USD; Trịnh Thanh Hùng (cựu vụ phó Vụ KH-CN) 350.000 USD; Nguyễn Nam Liên (cựu vụ trưởng Vụ Kế hoạch Tài chính Bộ Y tế) 100.000 USD.
Cạnh đó, Việt còn chi tiền "cảm ơn" cho ông Nguyễn Văn Trịnh 200.000 USD; Phạm Công Tạc (cựu Thứ trưởng Bộ KH&CN) 50.000 USD; Chu Ngọc Anh 200.000 USD.
Theo cơ quan điều tra, quá trình "chạy" cho Việt Á được tham gia đề tài nghiên cứu test, Phan Quốc Việt đã mang theo một balo màu xanh bên trong có 200.000 USD và một số khẩu trang, nước rửa tay đến trụ sở Bộ KH&CN biếu ông Chu Ngọc Anh, số tiền này cựu Bộ trưởng bỏ quên hàng tháng trời tại phòng làm việc.
Ngày 29/12, Tòa án Quân sự Thủ đô Hà Nội quyết định tuyên phạt Phan Quốc Việt 15 năm tù về tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ" và 10 năm tù về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng". Tổng hợp hình phạt cả 2 tội danh, ông chủ Việt Á phải chấp hành mức án chung là 25 năm tù.
Bản án xác định, do vụ lợi cá nhân nên từ tháng 1/2020, Trịnh Thanh Hùng thông đồng với Phan Quốc Việt và Hồ Anh Sơn (thượng tá, cán bộ HVQY) đưa Công ty Việt Á vào tham gia Đề tài nghiên cứu kit test COVID-19. Sau đó, để Công ty Việt Á được cấp phép và sản xuất thương mại trái pháp luật bộ kit. Hành vi của các bị cáo dẫn đến quy trình nghiên cứu của Học viện Quân y không có sản phẩm được thử nghiệm, đánh giá và hậu quả là đề tài không hoàn thành, gây thiệt hại hơn 18 tỷ đồng.
Cơ quan chức năng xác định, Việt đã “biếu” hơn 7 tỷ đồng cho ông Hùng và nhóm cựu sĩ quan quân nhân thuộc HVQY.