Sau đó Công ty VNDAT phê duyệt mức chi "hoa hồng" là 15% giá trị gói thầu (trước VAT), Nguyễn Thị Thúy đã chỉ đạo cấp dưới chuyển tiền 2 lần vào tài khoản ông Trần Văn Hiệp (anh trai ông Huy) cho ông Huy nhận và Thúy trực tiếp đưa tiền mặt một lần cho Huy với tổng số tiền gần 2 tỷ đồng.
Toàn bộ số tiền nêu trên nhận được từ Công ty VNDAT, ông Huy đưa lại bằng tiền mặt cho ông Huỳnh Văn Dõng tại phòng làm việc CDC.
Ông Dõng sử dụng số tiền này cho lại ông Huy 30 triệu đồng, nhờ ông Huy đưa cho bà Mai Thị Minh Truyền (Kế toán trưởng) 50 triệu đồng. Số tiền còn lại gần 1,9 tỷ đồng, ông Dõng sử dụng cá nhân.
Quá trình điều tra, ông Huỳnh Văn Dõng, ông Trần Quốc Huy và bà Mai Thị Truyền đã giao nộp toàn bộ số tiền gần 2 tỷ đồng nhận được từ Công ty VNDAT.
Vi phạm Luật đấu thầu
Theo Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Khánh Hòa, ông Huỳnh Văn Dõng và ông Trần Quốc Huy đã có hành vi lợi dụng chức vụ, quyền hạn can thiệp trái pháp luật vào hoạt động đấu thầu, không đảm bảo khách quan, minh bạch trong đấu thầu, vì vụ lợi, làm trái các quy định của Luật Đấu thầu 2013 gây hậu quả thiệt hại nghiêm trọng.
Việc ông Huỳnh Văn Dõng và ông Trần Quốc Huy ký kết, thực hiện trái pháp luật 5 hợp đồng CDC Khánh Hòa mua hàng hóa của Công ty VNDAT tổng cộng 116.000 test xét nghiệm Covid-19 thông qua hình thức đấu thầu 5 gói thầu tổng trị giá hơn 14 tỷ đồng vào năm 2021 nêu trên có sự giúp sức tích cực của Nguyễn Thị Thúy; để Huỳnh Văn Dõng và Trần Quốc Huy được hưởng lợi số tiền gần 2 tỷ đồng; tạo điều kiện cho Công ty VNDAT thu được lợi nhuận 370%, gây thiệt hại tài sản cho Nhà nước số tiền gần 10 tỷ đồng.
Hành vi trên của Huỳnh Văn Dõng, Trần Quốc Huy, Nguyễn Thị Thúy đã đủ các yếu tố cấu thành tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" theo quy định tại khoản 3 Điều 222 Bộ luật Hình sự.
Trong đó, Huỳnh Văn Dõng là đối tượng có vai trò tổ chức, chủ mưu, cầm đầu; Trần Quốc Huy có vai trò thực hành; Nguyễn Thị Thúy có vai trò đồng phạm giúp sức.