Trong khi đó, các trường học lại gặp vô vàn khó khăn trong tổ chức giáo dục di sản, như thiếu thời gian, kinh phí và gay go nhất là thiếu phương tiện dạy học cũng như các hướng dẫn. Chính vì vậy, mức độ đạt được mục tiêu khi giáo dục di sản văn hóa cho học sinh còn thấp. Ở không ít trường học, giáo dục di sản văn hóa chỉ dừng lại ở hoạt động ngoại khóa, phong trào, chủ yếu vẫn là một năm có 1 - 2 lần tổ chức cho học sinh đi thăm bảo tàng, thiết chế văn hóa, di tích lịch sử.
Sự phối hợp giữa các bảo tàng, thiết chế văn hóa, di tích lịch sử với trường học trong giáo dục di sản văn hóa là hết sức cần thiết. Không chỉ giúp phát huy, lan tỏa sâu rộng các giá trị lưu trữ vào đời sống, giáo dục di sản văn hóa còn góp phần bồi đắp cho thế hệ tương lai tình yêu và lòng tự hào với di sản văn hóa của đất nước. Sự phối hợp này còn mở ra cho ngành hoàn thành mục tiêu giáo dục con người toàn diện, đặc biệt là giáo dục kỹ năng sống cho học sinh.
Do đó, giáo dục di sản văn hóa cần phải đạt được yếu tố thực chất, hiệu quả, bền vững, chứ không đơn thuần chỉ là hoạt động phong trào. Kinh nghiệm từ thành phố Hội An, tỉnh Quảng Nam - địa phương thực hiện thành công hoạt động đưa di sản văn hóa vào giáo dục trong trường học cho thấy, bên cạnh nâng cao nhận thức vai trò giáo dục di sản trong học đường, xây dựng kế hoạch cụ thể dài hơi, tăng cường sự quan tâm, phối kết hợp giữa chính quyền và liên ngành Văn hóa, Thể thao & Du lịch và Giáo dục, rất cần đẩy mạnh tập huấn, hướng dẫn cho đội ngũ giáo viên và xây dựng chương trình, tài liệu dạy học.
Biên soạn hệ thống giáo án với sự kết hợp từ hai ngành như bộ tài liệu “Giáo dục di sản trong học đường ở Hội An”, tăng cường tập huấn cho người trực tiếp làm công tác giáo dục di sản trong nhà trường phải được xem là hai khâu đặc biệt quan trọng. Để làm tốt, chủ thể chính vẫn là ngành Giáo dục, thế nhưng không thể thiếu sự phối hợp trực tiếp của ngành văn hóa và các ngành, bộ phận khác hỗ trợ. Nâng tính chuyên nghiệp thì công tác giáo dục di sản trong nhà trường mới có thể vượt qua tính chất phong trào, đạt hiệu quả lâu dài, góp phần bảo tồn bền vững cho các di sản văn hóa của quê hương, đất nước.