Điều đáng nói, một số trường có điểm tuyển sinh đầu vào cao, tỷ lệ học sinh đỗ tốt nghiệp luôn đạt 100%, vẫn có môn học điểm số của học sinh lại thấp bất thường. Trường THPT Lê Quý Đôn, quận Hà Đông có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 15 thành phố, nhưng môn Hóa học lại đứng thứ 139. Trường THPT Phan Huy Chú, quận Đống Đa có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 29 thành phố, nhưng môn Vật lý đứng thứ 142, môn Hóa học đứng thứ 146.
Trường THCS-THPT Vinschool, quận Hai Bà Trưng có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 30 thành phố, nhưng môn Ngữ văn đứng thứ 136.
Trường THCS - THPT Lê Quý Đôn, quận Nam Từ Liêm có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 25 thành phố, nhưng môn Toán đứng thứ 123.
Trường THPT Xuân Giang có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 44 thành phố, nhưng môn tiếng Anh đứng thứ 136.
Trường THPT Đoàn Kết, quận Hai Bà Trưng có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 46 thành phố, nhưng môn Địa lý đứng thứ 108.
Trường THPT Trần Phú có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 42 thành phố, nhưng môn Lịch Sử đứng thứ 98.
Trường THPT Xuân Đỉnh có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 32 thành phố, nhưng môn GDCD đứng thứ 84.
Trường THPT Quốc Oai có tổng điểm thi tốt nghiệp đứng thứ 50 thành phố, nhưng môn Sinh học, Hóa học lần lượt đứng thứ 112, 128 thành phố.