Theo Viện kiểm sát, Bộ Y tế đã kiểm tra giá hiệp thương, xác định Việt Á thay đổi nguyên vật liệu sản xuất nhưng không ra kết luận kiểm tra, không kiến nghị xử lý, dẫn đến Công ty Việt Á tiếp tục sử dụng mức giá trên, tạo mặt bằng giá để bán cho các đơn vị, địa phương.
Kết quả điều tra xác định trong năm 2020 và 2021, tổng doanh thu của Công ty Việt Á là hơn 4.247 tỷ đồng.
Trong đó, Công ty Việt Á đã sản xuất tổng hơn 8,7 triệu kit test, đã tiêu thụ cho các đơn vị, cơ sở y tế là hơn 8,3 triệu kit test với tổng giá trị hơn 3.929 tỷ đồng (giá 470.000 đồng/kit). Doanh nghiệp này cũng đã được thanh toán hơn 5.918.266 kit với tổng giá trị 2.257 tỷ đồng.
Hành vi phạm tội của Phan Quốc Việt cùng nhóm cựu quan chức cấp cao đã gây thiệt hại hơn 432 tỷ đồng.
Ngoài ra, cơ quan tố tụng xác định Phan Quốc Việt đã hối lộ với tổng số tiền 3 triệu USD và 4 tỷ đồng. Trong đó, chuyển cho Nguyễn Thanh Long 2,25 triệu USD; Nguyễn Huỳnh (thư ký của ông Long) 4 tỷ đồng; đưa cho Nguyễn Minh Tuấn (cựu vụ trưởng Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế Bộ Y tế) 300.000 USD; chi cho Trịnh Thanh Hùng (cựu vụ phó Vụ KH-CN) 350.000 USD; đưa cho Nguyễn Nam Liên (cựu vụ trưởng Vụ Kế hoạch Tài chính Bộ Y tế) 100.000 USD.
Cạnh đó, Việt còn chi tiền “cảm ơn” cho ông Nguyễn Văn Trịnh 200.000 USD; Phạm Công Tạc (cựu Thứ trưởng Bộ KH&CN) 50.000 USD; Chu Ngọc Anh 200.000 USD.
Theo cơ quan điều tra, quá trình “chạy” cho Việt Á được tham gia đề tài nghiên cứu test, Phan Quốc Việt đã mang theo một balo màu xanh bên trong có 200.000 USD và một số khẩu trang, nước rửa tay đến trụ sở Bộ KH&CN biếu ông Chu Ngọc Anh, số tiền này bị cựu Bộ trưởng bỏ quên hàng tháng trời tại phòng làm việc.