Năm trong số 6 nhân viên của lực lượng Cảnh sát biển Nhật Bản trên máy bay đã thiệt mạng, còn phi công sống sót với những vết thương nặng sau vụ va chạm.
Tất cả 379 hành khách và thành viên phi hành đoàn trên chiếc chiếc Airbus A350 được sơ tán an toàn. Mười lăm hành khách bị thương hoặc cảm thấy không khỏe đã được điều trị y tế.
Ngày 6-1, có 216 chuyến bay nội địa đến và đi từ sân bay Haneda, thủ đô Tokyo, đã bị hủy bỏ. Trong đó, hãng Japan Airlines có 100 chuyến, hãng All Nippon Airways có 96 chuyến, hãng Starflyer có 14 chuyến và hãng Solaseed Air có 6 chuyến.
Ước tính ít nhất 32.300 hành khách bị ảnh hưởng, bao gồm 14.300 hành khách của Japan Airlines và 18.000 hành khách của All Nippon Airways. Hoạt động tại sân bay Haneda dự kiến tiếp tục bị gián đoạn trong ngày 7-1. Đường băng xảy ra vụ va chạm sẽ được mở lại từ ngày 8-1, theo Bộ Giao thông Vận tải Nhật Bản.