Ban Chỉ đạo được đề xuất kiểm điểm, thay thế chủ đầu tư, nhà thầu tham gia yếu kém, không đáp ứng yêu cầu tiến độ dự án hoặc triển khai dự án không đảm bảo chất lượng, hiệu quả đầu tư.
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ nghiên cứu tham mưu UBND TP HCM chỉ đạo, triển khai đầu tư và đẩy nhanh tiến độ thực hiện các dự án trọng điểm như: tuyến Metro số 1, Metro số 2, đường Vành đai 3, Vành đai 4, rạch Xuyên Tâm, kênh Tham Lương - Bến Cát, Khu Công nghệ Môi trường Xanh... kết hợp với việc khai thác các quỹ đất xung quanh dự án trọng điểm.
Đồng thời, nghiên cứu và xây dựng mô hình phát triển đô thị theo định hướng phát triển giao thông công cộng (TOD). Rà soát và đề xuất UBND TP HCM các dự án ưu tiên đầu tư kết cấu hạ tầng giao thông, kỹ thuật, xã hội để khai thác hiệu quả quỹ đất xung quanh nhà ga và dọc các dự án nêu trên.
Ban Chỉ đạo các dự án trọng điểm còn có nhiệm vụ rà soát phạm vi, quy mô đầu tư, phương án kỹ thuật, công nghệ, tác động môi trường, tổng mức đầu tư dự án, quỹ đất công dọc tuyến đường và quy hoạch đất nông nghiệp tại khu ít dân cư để tạo quỹ đất sạch.
Ngoài ra, đề xuất các cơ chế, chính sách cần thiết, khả thi nhằm hỗ trợ chủ đầu tư thực hiện lập đề xuất chủ trương đầu tư dự án và tham mưu UBND TP HCM giải pháp đẩy nhanh tiến độ triển khai dự án đảm bảo hiệu quả đầu tư.