Tổng kinh phí để thực hiện chương trình này là 151,9 tỷ đồng; trong đó kinh phí mua sữa khoảng 150 tỷ đồng.
UBND tỉnh Quảng Nam cũng yêu cầu Ban chỉ đạo Chương trình sữa học đường triển khai thực hiện chương trình. Đồng thời thường xuyên tổ chức kiểm tra, đôn đốc, hướng dẫn thực hiện Chương trình sữa học đường ở các địa phương.
Sở GD&ĐT là cơ quan thường trực, có trách nhiệm tham mưu UBND tỉnh chỉ đạo thực hiện chương trình; tham mưu xây dựng kế hoạch, thành lập Ban chỉ đạo, Tổ giúp việc thực hiện chương trình. Làm đầu mối tiếp nhận, tổ chức triển khai thực hiện chương trình;
Tổ chức mua sắm, phân bổ nguồn sữa cấp cho các trường theo đúng kế hoạch, dự trù, thanh quyết toán kinh phí theo đúng quy định... Bên cạnh đó, phối hợp với Sở Y tế giám sát, kiểm tra chất lượng sữa và đánh giá tình trạng dinh dưỡng của trẻ mẫu giáo và học sinh tiểu học.