Trong đó, từ năm 1995 - 2021 ông công tác tại Tổng Công ty Xây dựng Hà Nội (Hancorp).
Thời gian làm việc tại Tổng công ty Xây dựng Hà Nội, ông Bùi Xuân Dũng đảm nhiệm vị trí như: Quyền Tổng Giám đốc Tổng Công ty xây dựng Hà Nội từ năm 2013 – 2014; năm 2014 - 2015: Bí thư Đảng ủy, Chủ tịch Hội đồng thành viên, Tổng Giám đốc Tổng Công ty xây dựng Hà Nội; năm 2015 đến tháng 3-2021 là Bí thư Đảng ủy, Chủ tịch Hội đồng thành viên Tổng Công ty xây dựng Hà Nội.
Từ tháng 3-2021 đến tháng 10-2022, ông làm Cục trưởng Cục Quản lý nhà và thị trường bất động sản, Bộ Xây dựng.
Từ tháng 10-2022 đến 9-2023, ông làm Chủ tịch Hội đồng thành viên Tổng Công ty Xi măng Việt Nam.
Ngày 15-9-2023, ông Bùi Xuân Dũng được Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm giữ chức Thứ trưởng Bộ Xây dựng.