Ngay sau khi xảy ra sự việc, ông Thào Hồng Sơn, Phó Bí thư Thường trực Tỉnh ủy, Chủ tịch HĐND tỉnh Hà Giang đã đến hiện trượng trực tiếp chỉ đạo Ban chỉ huy phòng, chống thiên tai, tìm kiếm cứu nạn huyện Bắc Mê và cấp ủy, chính quyền địa phương cùng đông đảo nhân dân, ngư dân tổ chức tìm kiếm, cứu nạn nhưng do khu vực bị nạn, dòng sông rộng và sâu nên công tác tìm kiếm gặp nhiều khó khăn.
Sau nhiều nỗ lực tìm kiếm, đến khoảng 9 giờ ngày 6/10, lực lượng chức năng đã tìm thấy thi thể của em Hà Ngọc L. (16 tuổi). Sau khi hoàn tất công tác khám nghiệm tử thi, Ban chỉ huy đã bàn giao thi thể em L. cho gia đình về an táng theo phong tục của địa phương.
Hiện tại, lực lượng chức năng tỉnh Hà Giang đang nỗ lực hết mình để tìm kiếm các em học sinh đang còn mất tích.