Riêng các cơ sở giáo dục ngoài công lập được quyền chủ động xây dựng mức thu học phí và giá các dịch vụ khác trong lĩnh vực giáo dục và đào tạo (trừ dịch vụ do nhà nước định giá) đảm bảo bù đắp chi phí và có tích lũy hợp lý, có trách nhiệm công khai, giải trình với người học và xã hội về mức thu học phí, giá các dịch vụ do mình quyết định.
Bên cạnh đó, các cơ sở giáo dục công lập, ngoài công lập và cơ sở giáo dục nghề nghiệp có học sinh thuộc đối tượng được hưởng chính sách có trách nhiệm phải hoàn trả (nếu đã tổ chức thu) và khấu trừ phần hỗ trợ học phí tương ứng với mức hỗ trợ mà HĐND TPHCM thông qua cho các tháng thực học.
Cụ thể, mức thu hỗ trợ được quy định như sau:
Ngoài ra, Sở Giáo dục và Đào tạo TPHCM cũng yêu cầu các cơ sở giáo dục đã thu học phí theo mức mới thì hoàn trả cho phụ huynh khoản chênh lệch. Sau đó, các nhà trường sẽ có báo cáo cụ thể để nhận kinh phí cấp bù (kinh phí hỗ trợ học phí của thành phố dành cho học sinh).