Theo PGS.TS Nguyễn Thu Thủy - Vụ trưởng Vụ Giáo dục Đại học (Bộ GD&ĐT), thí sinh có thể đăng ký nhiều nguyện vọng vào 1 trường và nhiều trường, nhưng chỉ khi đăng ký trên hệ thống của Bộ GD&ĐT thì việc xếp ưu tiên các nguyện vọng mới có ý nghĩa, vì phần mềm sẽ tự động chạy lọc ảo để thí sinh trúng tuyển một nguyện vọng được ưu tiên cao nhất theo đăng ký trên hệ thống này. Trước đó, thí sinh có thể đăng ký xét tuyển tại trường để có danh sách trúng tuyển tạm thời và cập nhật lên hệ thống.
Dựa vào nguyên lý trên, nếu thí sinh đã xác định được ngành yêu thích nhất và đặt nó ở vị trí số 1 trên hệ thống của Bộ GD&ĐT, thì khi đủ điều kiện trúng tuyển ở nguyện vọng này, chắc chắn sẽ được tuyển vào ngành yêu thích. Lẽ tất nhiên, điều kiện tối quan trọng để thí sinh trúng tuyển là phải có kết quả tốt nghiệp THPT.
Bộ GD&ĐT nhiều lần lưu ý, phần mềm chỉ hỗ trợ lọc ảo và không làm thay nhiệm vụ xét tuyển của các cơ sở giáo dục đại học. Do đó, cơ sở đào tạo có thể chủ động thực hiện công tác xét tuyển, hoặc phối hợp thành nhóm trường trong việc chạy phần mềm xét tuyển. Bộ cũng khuyến khích các trường đại học sử dụng hệ thống riêng cho phương thức xét tuyển khác học bạ hoặc dựa trên học bạ nhưng phức tạp hơn.
Tuy nhiên, các trường cần thông báo rõ cho thí sinh để đăng ký, nộp hồ sơ xét tuyển vào trường, đồng thời đăng ký nguyện vọng trên hệ thống phần mềm của Bộ GD&ĐT. Với cách làm này, các trường có thể chạy phần mềm xét tuyển trước, nhưng vẫn tải danh sách thí sinh trúng tuyển lên hệ thống của Bộ để tiến hành lọc ảo cùng với các phương thức xét tuyển khác.