Trụ sở UBND TP Hà Nội
Từ những ý kiến chỉ đạo của cựu chủ tịch Hà Nội, Ban Duy tu các công trình kỹ thuật đô thị (Sở Xây dựng Hà Nội) đã ký hợp đồng đặt hàng trực tiếp với Công ty Cây xanh và Công ty Sinh Thái Xanh. Trong đó, Ban Duy tu các công trình kỹ thuật đô thị đã đặt hàng Công ty Cây xanh 10 hợp đồng trị giá hơn 241 tỉ đồng, Công ty Sinh Thái Xanh 6 hợp đồng trị giá hơn 43 tỉ đồng. Trong quá trình thực hiện hợp đồng, nhóm cán bộ Ban Duy tu và 2 doanh nghiệp Công ty Cây xanh và Công ty Sinh Thái Xanh đã bắt tay nâng khống giá, gây thiệt hại cho nhà nước hơn 34 tỉ đồng.
Trong quá trình điều tra vụ án, ngoài những bị can bị cáo buộc trách nhiệm hình sự, C03 cũng đã làm việc với nhiều cá nhân, tổ chức có nghĩa vụ liên quan. Trong đó, có nhiều người đang là lãnh đạo TP Hà Nội như các ông: Nguyễn Thế Hùng, nguyên phó chủ tịch UBND TP Hà Nội; Nguyễn Mạnh Quyền, Phó chủ tịch Hà Nội (cựu giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư); Nguyễn Doãn Toản hiện là Trưởng Ban Tuyên giáo Hà Nội; Lê Văn Dục, cựu giám đốc Sở Xây dựng Hà Nội, và Võ Nguyên Phong, Giám đốc Sở Xây dựng Hà Nội, cùng nhiều người khác.
Kết luận điều tra thể hiện ông Nguyễn Thế Hùng được giao ký văn bản phê duyệt phương án lựa chọn nhà thầu, có ý kiến đồng ý cho Công ty Cây xanh và Công ty Sinh Thái Xanh thực hiện. Trong đó, ông Nguyễn Doãn Toản dù không phải là phó chủ tịch được giao ký các văn bản về phê duyệt phương án lựa chọn thầu, song theo phân công của bị can Nguyễn Đức Chung, ông này đã ký một văn bản đồng ý cho Công ty Sinh Thái Xanh thực hiện đặt hàng trồng cây trên địa bàn TP.
Đối với cán bộ thuộc Sở Xây dựng như các ông: Lê Văn Dục, cựu giám đốc Sở Xây dựng, và Võ Nguyên Phong, hiện nay là Giám đốc Sở Xây dựng Hà Nội, cùng nhiều cán bộ khác đã thực hiện việc đề xuất đặt hàng Công ty Cây xanh và Công ty Sinh Thái Xanh trồng cây xanh trái quy định. Tuy nhiên, theo C03, việc này đều xuất phát từ ý kiến chỉ đạo, áp đặt của bị can Nguyễn Đức Chung.
Theo C03, ngoài các bị can đã khởi tố và đề nghị truy tố, còn có một số cá nhân là lãnh đạo và cá nhân tại UBND TP Hà Nội, các Sở, Ban, ngành TP Hà Nội, Ban Duy tu... đã có hành vi, vi phạm liên quan ở các mức độ khác nhau. "Có cá nhân hoặc hành vi không cấu thành tội phạm hoặc chưa đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự hoặc chưa đến mức truy cứu trách nhiệm hình sự. Căn cứ tính chất, mức độ của hành vi sai phạm; đường lối chính sách pháp luật của Đảng, nhà nước, Cơ quan điều tra kết luận và có văn bản kiến nghị Thành ủy, UBND TP Hà Nội xử lý nghiêm theo các quy định của Đảng và chính quyền" - C03 kết luận.