Ngay sau đó, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an trưng cầu Cục An ninh chính trị nội bộ giám định Công văn 640 nêu trên, để làm rõ việc văn bản này có phải tài liệu bí mật nhà nước tại thời điểm ban hành không? Thuộc độ mật và danh mục bí mật Nhà nước trong lĩnh vực nào?
Vào cuộc xác minh, cơ quan chuyên môn xác định "mẫu giám định không phải là tài liệu bí mật nhà nước tại thời điểm ban hành". Do vậy, Bộ Công an kết luận hành vi lưu trữ hình ảnh bản photo là Công văn số 640 trong email của Trịnh Thị Minh Huế không đủ yếu tố cấu thành tội Chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước.
Trong quá trình thực hiện lệnh khám xét 21 địa điểm, chỗ ở, nơi làm việc của một số bị can, Bộ Công an đã phát hiện, thu giữ, tạm giữ đồ vật, tài liệu và 47 phương tiện điện tử gồm điện thoại di động, laptop, máy tính bảng, máy tính bàn...
Theo kết luận, bị can Trịnh Văn Quyết chỉ đạo người thân, nhân viên và các công ty con, sử dụng tài khoản chứng khoán để "thổi giá" các mã AMD, HAI, GAB, FLC, ART; qua đó hưởng lợi bất chính 723 tỉ đồng.
Ngoài ra, ông Quyết còn "phù phép", nâng khống vốn của Công ty CP Xây dựng Faros từ 1,5 tỉ đồng lên 4.300 tỉ đồng. Sau đó, cựu chủ tịch FLC đề nghị đăng ký niêm yết 430 triệu cổ phiếu ROS của Công ty CP Xây dựng Faros trên Sở giao dịch chứng khoán TP HCM để bán, chiếm đoạt 3.620 tỉ đồng của các nhà đầu tư. Số tiền thu lợi bất chính, bị can Trịnh Văn Quyết dùng để mua cổ phần tại hãng hàng không Bamboo Airways; trả nợ; gửi vào tài khoản chứng khoán và chi tiêu cá nhân…