Sông Nhuệ đoạn qua huyện Thường Tín hiện đang được xây cầu thuộc dự án Đường Vành đai 4- Vùng Thủ đô.
Dọc hai bên bờ sông Nhuệ đoạn qua phường Phú Diễn, quận Bắc Từ Liêm nhiều chỗ là nơi tập kết rác thải sinh hoạt.
Do nước sông ô nhiễm, cùng với rác thải nên khu vực Tổ dân phố Phú Diễn 1, Phú Diễn 2 luôn là điểm nóng dịch sốt xuất huyết.
Người dân cho biết, dù chính quyền thực hiện bất cứ biện pháp gì mà giải quyết được ô nhiễm sông Nhuệ, sông Đáy thì đều ủng hộ.