Khi nhận được tiền từ Thuduc House, Sài Gòn Tây Nam và Hoàng Nam Anh, ông Trịnh Tiến Dũng đã chỉ đạo chuyển tiền lòng vòng vào các tài khoản của tổ chức, cá nhân, rút toàn bộ 538 tỷ đồng tiền thuế giá trị gia tăng để chiếm đoạt.
Trong vụ án này, có 18 bị cáo nguyên là cán bộ, nhân viên thuộc Cục thuế trong đó bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh (cựu Phó Cục trưởng Cục thuế TPHCM) có chức vụ cao nhất. Bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh là người trực tiếp ký duyệt đề xuất hoàn thuế, quyết định hoàn thuế giá trị gia tăng và 15 lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách cho Thuduc House, gây thất thoát số tiền 331 tỷ đồng.
3 bị cáo là cựu cán bộ ngành thuế bị xét xử về tội “Nhận hối lộ”, có khung hình phạt lên đến tử hình, là bị cáo Đào Thị Nga (Chi cục Thuế quận 1), Nguyễn Phương Nam (Chi cục Thuế quận 3) và Ngô Huỳnh Lũy (Chi cục Thuế quận 5). Bị cáo Nam theo cáo trạng là đã nhận 6,1 tỷ đồng, bị cáo Nga nhận 776 triệu đồng và bị cáo Lũy đã nhận 497 triệu đồng của bị cáo Lưu Thị Ngát (cựu Giám đốc Công ty TNHH Hưng Khánh).
Vụ án còn có 7 cán bộ hải quan Cửa khẩu cảng Sài Gòn khu vực I (thuộc Hải quan TPHCM), đã không thực hiện đúng nhiệm vụ được giao, cập nhật thông tin lên hệ thống để thông quan cho các lô hàng và không phát hiện được hành vi buôn lậu của Trịnh Tiến Dũng và đồng phạm.
HĐXX do thẩm phán Phạm Lương Toản (Chánh tòa Hình sự TAND TPHCM) làm chủ tọa. Tại quyết định đưa vụ án ra xét xử, HĐXX cho biết phiên tòa dự kiến diễn ra đến ngày 10/7.