Nguyên nhân là do UBND huyện Chư Sê và các phòng, ban đã tham mưu không đúng các quy định của Luật Đất đai 2013.
Chẳng hạn, tại Dự án đường Hồ Chí Minh tránh qua huyện Chư Sê, UBND huyện khi giải phóng mặt bằng đã tính thiếu kinh phí hỗ trợ đào tạo, chuyển đổi nghề, giải quyết việc làm cho 217 hộ dân. Bộ GTVT xác định việc áp dụng chính sách giải phóng mặt bằng chưa đúng với quy định, dẫn đến phải bổ sung kinh phí là lỗi của UBND huyện Chư Sê.
Tại Dự án mở rộng khu trung tâm hành chính và đô thị sinh thái phía Đông thị trấn Chư Sê, hàng chục hộ dân không được hỗ trợ kinh phí đào tạo, chuyển đổi nghề, giải quyết việc làm, khiến họ liên tục khiếu nại kéo dài.
Lô đất nằm ở trung tâm dự án được UBND huyện Chư Sê điều chỉnh quy hoạch trái với quy hoạch chung để đưa ra ngoài dự án, cho chuyển đổi sang đất ở và giao đất không qua đấu giá
Cũng tại dự án này, UBND huyện Chư Sê đã nhiều lần "phá rào", điều chỉnh quy hoạch trái với quy hoạch tổng thể để đưa khỏi quy hoạch 7.000 m2 của hộ ông Bùi Chính (trú huyện Chư Sê). Khi vị trí đất ông Bùi Chính đang được quy hoạch để thực hiện dự án, UBND huyện Chư Sê cũng cho phép chuyển đổi sang đất ở, cho nợ tiền sử dụng đất. Ngoài ra, UBND huyện còn giao cho ông Chính hàng trăm mét vuông đất ở không thông qua đấu giá.