ĐH Việt Đức được ra đời từ ý tưởng của ông Udo Corts, nguyên Bộ trưởng Đại học, Nghiên cứu và Nghệ thuật bang Hessen (Đức) và ông Nguyễn Thiện Nhân, nguyên Bộ trưởng Bộ GD&ĐT từ năm 2005.
Đến năm 2008, ĐH Việt Đức chính thức được thành lập trên cơ sở thỏa thuận giữa hai chính phủ. Tất cả chương trình đều do hầu hết giáo sư từ các trường đối tác Đức giảng dạy. Sinh viên tốt nghiệp nhận được văn bằng chính thức từ các trường đối tác Đức.