Tại kỳ họp lần thứ 16 HĐND TPHCM khóa VII diễn ra vào ngày 9/7/2009, ông Hứa Ngọc Thuận được bầu làm Phó Chủ tịch UBND TPHCM phụ trách lĩnh vực văn hóa - xã hội. Ông tiếp tục được HĐND TPHCM khoá VIII bầu giữ chức vụ Phó Chủ tịch UBND TPHCM nhiệm kỳ 2011 – 2016.
Phó Chủ tịch UBND TPHCM Hứa Ngọc Thuận thăm mẹ Việt Nam anh hùng Bùi Thị Định (phường 2, quận 4) vào tháng 7/2013
Cuối năm 2016, ông Thuận nhận quyết định nghỉ hưu để hưởng chế độ bảo hiểm xã hội.
Trước khi được bầu giữ chức Phó Chủ tịch UBND TPHCM, ông Hứa Ngọc Thuận từng giữ các vị trí quan trọng của thành phố, như: Chánh Văn phòng Thành uỷ TPHCM, Bí thư Quận uỷ Quận Gò Vấp, Trưởng ban Quản lý Khu Nam Sài Gòn.