Theo phân công, Bộ Y tế là một trong các cơ quan sẽ cho ý kiến về việc phê duyệt hoặc không phê duyệt kế hoạch tổ chức chuyến bay theo đề xuất của Bộ Ngoại giao. Bộ Y tế còn có thẩm quyền chấp thuận cho khách lẻ được về nước theo đề nghị của các cá nhân, DN.
Để thực hiện nhiệm vụ trên, Bộ Y tế phân công ông Đỗ Xuân Tuyên, Thứ trưởng, Phó trưởng Ban chỉ đạo, thành viên tổ công tác 5 bộ, khi nhận được văn bản xin ý kiến về chuyến bay sẽ chuyển Cục Y tế dự phòng tham mưu, đề xuất. Dự thảo văn bản trả lời gửi thông qua bị can Phạm Trung Kiên (Thư ký của ông Tuyên), tiếp đó ông Kiên trình ông Tuyên xem xét, duyệt ký.
Lợi dụng vị trí công việc, ông Kiên đã tiếp xúc, yêu cầu các DN và cá nhân liên quan đến chuyến bay phải "bôi trơn" từ 50 - 200 triệu đồng/chuyến, hoặc từ 500.000 - 2 triệu đồng/khách; riêng với khách lẻ thì từ 7 - 15 triệu đồng/người. Nếu chi tiền thì ông Kiên mới giúp đỡ, không gây khó khăn và trình sớm để cấp trên là ông Tuyên ký công văn chấp thuận chuyến bay hoặc đồng ý để khách lẻ được về nước.
Ngoài ra, ông Kiên còn cùng bị can Vũ Anh Tuấn (cựu cán bộ Cục Quản lý xuất nhập cảnh, Bộ Công an) yêu cầu, gợi ý, chỉ dẫn để DN liên hệ, chi tiền cho ông Kiên, nhằm được Bộ Y tế chấp thuận chuyến bay, trả lời kịp thời văn bản.
Kết quả điều tra xác định, bằng thủ đoạn trên, ông Kiên nhận hối lộ hơn 250 lần, với tổng cộng gần 43 tỉ đồng. Đây cũng là bị can bị cáo buộc nhận tiền "bôi trơn" nhiều nhất trong vụ án.
Ở một diễn biến khác, hồi tháng 5.2022, tại kỳ họp thứ 15, Ủy ban Kiểm tra T.Ư quyết định khiển trách ông Đỗ Xuân Tuyên do có vi phạm liên quan đến vụ kit test Việt Á.
Vẫn theo kết luận điều tra, trong số 54 bị can bị đề nghị truy tố, ngoài hành vi đã được Cơ quan ANĐT làm rõ, nhiều người còn tự khai báo về việc đưa, nhận tiền hối lộ với một số cá nhân khác.
Điển hình như lời khai của bị can Nguyễn Quang Linh về việc đã chuyển một phần trong số tiền mình nhận hối lộ cho người khác; hoặc ngoài ông Trần Văn Tân (cựu Phó chủ tịch UBND tỉnh Quảng Nam) nhận hối lộ 5 tỉ đồng, một số cá nhân khác tại tỉnh này cũng liên quan đến việc nhận tiền từ DN; rồi việc hàng loạt chủ DN khai còn chi tiền cho nhiều cá nhân khác ngoài 21 bị can đã bị đề nghị truy tố về tội nhận hối lộ…
Cơ quan ANĐT Bộ Công an cho biết sẽ tiếp tục điều tra dấu hiệu sai phạm tại một số bộ, ngành, DN liên quan đến "chuyến bay giải cứu" ở giai đoạn sau.