Riêng ông Chu Ngọc Anh còn vướng sai phạm khi đồng ý để Phạm Công Tạc chủ trì tổ chức họp báo, ra thông cáo báo chí thể hiện Bộ Y tế đã cấp phép sử dụng test xét nghiệm cho Công ty Việt Á, năng lực sản xuất của doanh nghiệp; ký các quyết định khen thưởng, tờ trình đề nghị Thủ tướng Chính phủ khen thưởng cho Công ty Việt Á.
Cựu Bộ trưởng cũng chỉ đạo ông Trần Văn Tùng, Thứ trưởng Bộ KH&CN ký công văn gửi UBND TPHCM đề nghị giúp Công ty Việt Á được tặng Huân chương Lao động hạng ba không đúng đối tượng, thành tích để hỗ trợ truyền thông, quảng bá hình ảnh, tạo điều kiện cho Công ty Việt Á biến test xét nghiệm từ sản phẩm nghiên cứu thuộc sở hữu Nhà nước thành sản phẩm thương mại của doanh nghiệp.
"Sai phạm của Chu Ngọc Anh, Phạm Công Tạc đã gây thất thoát số tiền 18,98 tỷ đồng ngân sách", cáo trạng chỉ rõ.
Thoát tội nhận hối lộ
Đáng chú ý, sau khi thực hiện trái pháp luật, có lợi cho Công ty Việt Á, Chu Ngọc Anh và Phạm Công Tạc được Phan Quốc Việt đưa tiền "cám ơn".
Trong đó, Việt đưa cho Chu Ngọc Anh số tiền 200.000 USD (hơn 4,6 tỷ đồng). Tại bản kết luận điều tra của C03 trước đó nêu, khi Việt tìm đến phòng làm việc của ông Ngọc Anh có nói: "Tụi em mới có được ít thanh toán, ghé cám ơn anh đã ủng hộ tụi em tham gia đề tài và hỗ trợ tụi em rất nhiệt tình. Nếu tình hình tốt, sắp tới em sẽ ghé thăm anh tiếp". Cựu Bộ trưởng Chu Ngọc Anh đáp lại: "Tớ cám ơn Việt" rồi đồng ý nhận chiếc túi màu xanh bên trong chứa tiền và nước rửa tay khô do Việt Á sản xuất.
Tuy nhiên, dù nhận tiền nhưng cựu Bộ trưởng không bị truy tố tội "Nhận hối lộ".
Cựu Thứ trưởng Phạm Công Tạc được Phan Quốc Việt biếu số tiền 50.000 USD (hơn 1,1 tỷ đồng). Quá trình điều tra, ông này chỉ khai nhận của Việt 100 triệu đồng, song căn cứ vào lời khai của các bị can Việt, Trịnh Thanh Hùng, Vũ Đình Hiệp, dữ liệu điện tử, sao kê tài khoản ngân hàng, kết quả thực nghiệm điều tra thấy đủ cơ sở xác định ông Tạc đã nhận 50.000 USD.