Năm 2002 trường chính thức chuyển về làm việc tại địa điểm này, thử thách mới lại bắt đầu. Tiếp theo đó là cả một quá trình xây dựng, sửa chữa để đến hôm nay có được một cơ ngơi tương đối khang trang đáp ứng yêu cầu của các hoạt động giảng dạy và học tập.
Trong giai đoạn này, chất lượng giáo dục của trường đã được khẳng định, thành tích về thi học sinh giỏi, thi đại học luôn đứng ở tốp đầu trong khu vực, tỷ lệ học sinh tốt nghiệp lớp 12 hằng năm luôn đạt trên 98%.
Trong 30 năm qua, có 246 cán bộ, giáo viên, nhân viên đã từng công tác và giảng dạy tại trường. Các thế hệ nhà giáo của trường đã tận tâm, tận lực vì học sinh thân yêu, đoàn kết, gắn bó với sự nghiệp giáo dục và đào tạo, thực hiện theo lời Bác dạy “dù khó khăn đến đâu, cũng phải thi đua dạy tốt, học tốt”.
Các thầy giáo, cô giáo sống giản dị, mẫu mực, có tác phong sư phạm, có chuyên môn nghiệp vụ vững vàng, tích cực đổi mới phương pháp, luôn cần cù sáng tạo trong lao động dạy học và được học sinh kính trọng, nhân dân tin yêu.
Trong 30 năm qua, trường THPT Vân Cốc đã đón 11.417 học sinh vào học, trong đó có hàng trăm học sinh giỏi tỉnh, thành phố, hàng ngàn học sinh đỗ đại học và có 9954 học sinh đã tốt nghiệp ra trường. Nhiều học sinh đã trở thành những công dân gương mẫu, đi đầu trong xây dựng và bảo vệ Tổ quốc; nhiều học sinh đã trở thành những lao động giỏi trong các nhà máy, xí nghiệp, trên mọi miền của đất nước…
Nhân kỷ niệm 30 năm thành lập trường THPT Vân Cốc, thầy và trò nhà trường vô cùng vinh dự và tự hào được Bộ Giáo dục và Đào tạo, UBND Thành phố Hà Nội tặng Bằng khen để ghi nhận những thành tích mà nhà trường đạt được trong suốt chặng đường 30 năm qua.
Trong năm học 2021 - 2022, các tập thể cá nhân nhà trường ra sức thi đua và đã đạt được nhiều thành tích xuất sắc. Để động viên kịp thời và nhân rộng những tấm gương điển hình trong giảng dạy và học tập, Sở Giáo dục và Đào tạo khen thưởng những tập thể, cá nhân có thành tích xuất sắc trong các hoạt động và phong trào của nhà trường.