Theo quy hoạch, tuyến đường sắt TP HCM - Cần Thơ có chiều dài khoảng 174 km đi qua 6 tỉnh/thành phố, đường đôi, khổ 1435 mm, lộ trình nghiên cứu, đầu tư trước năm 2030.
8 tuyến đường sắt kết nối vùng gồm Trảng Bom - Hòa Hưng (Sài Gòn), Biên Hòa - Vũng Tàu, Dĩ An - Lộc Ninh, TP HCM - Cần Thơ, TP HCM - Nha Trang, Thủ Thiêm - Long Thành, TP HCM - Tây Ninh, tuyến đường sắt chuyên dụng ra cảng Hiệp Phước.
Ba tuyến đường sắt được Long An quy hoạch gồm tuyến đường sắt đô thị Hưng Nhơn - Tân An; tuyến đường sắt chuyên dùng ga Long Định - cảng Hiệp Phước và tuyến đường sắt quốc gia TP HCM - Cần Thơ.
Viện Nghiên cứu vùng và đô thị (Liên hiệp các hội khoa học và kỹ thuật TP HCM) đề xuất điều chỉnh hướng tuyến đường sắt TP HCM - Cần Thơ (đoạn trên địa bàn TP HCM và tỉnh Bình Dương) đi sát vành đai 3 khu vực TP HCM.