Theo cáo trạng, Phan Quốc Việt đã chỉ đạo cấp dưới là Lê Trung Nguyên tổ chức việc ứng trước kit xét nghiệm cho CDC Bình Dương và thực hiện thanh toán sau đó theo giá mà Việt Á đề xuất, vi phạm quy định pháp luật. Tổng cộng, Phan Quốc Việt và Lê Trung Nguyên đã hợp tác với CDC Bình Dương để thanh toán tiền cho 5 gói thầu, ký 7 hợp đồng trị giá gần 83 tỷ đồng, gây thiệt hại 55,7 tỷ đồng cho Nhà nước.
Sau khi nhận tiền từ CDC Bình Dương, Phan Quốc Việt đã chỉ đạo cấp dưới chia phần trăm ngoài hợp đồng cho một số cá nhân. Tuy nhiên, ông Nguyễn Thành Danh và ông Nguyễn Hồng Chương đã từ chối nhận số tiền này.
Về hành vi “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, cáo trạng xác định rằng ông Danh đã thống nhất với Việt Á và công ty VNDAT về việc mượn kit xét nghiệm COVID-19, test tách chiết và vật tư y tế từ CDC Bình Dương để sử dụng trước, sau đó thực hiện thủ tục đấu thầu để Việt Á trúng thầu. Ông cũng đã chỉ đạo lập danh mục mua sắm, ghi rõ loại kit xét nghiệm với hãng sản xuất là Việt Á, tạo lợi thế cho Việt Á trong việc trúng thầu.
Có quan tố tụng cũng xác định, ông Nguyễn Thành Danh đã ký giấy rút dự toán ngân sách để thanh toán tiền cho 5 gói thầu, ký 7 hợp đồng trị giá gần 83 tỷ đồng theo giá mà Việt Á đề xuất, gây thiệt hại 55,7 tỷ đồng cho Nhà nước.