Tầng 1 là sự kết hợp hài hòa giữa không gian thiên nhiên và biển cả với điểm nhấn là 4 cột trưng bày dạng ống mang hình ảnh núi đá ở Hạ Long.
Trong mỗi ống núi lại mở ra một không gian với các chủ đề về địa chất, biển, động thực vật đặc hữu và các loài côn trùng tại Quảng Ninh.
Ngoài ra, hiệu ứng ánh sáng, màn hình led… làm nổi bật hệ sinh thái biển, khiến du khách như lạc vào giữa lòng đại dương mênh mông.
Tầng 2 - Khu trưng bày hiện vật
Tầng 2 là khu trưng bày những khảo cổ độc đáo mô phỏng đời sống, hoạt động của ngư dân vùng biển Quảng Ninh suốt mấy nghìn năm qua, từ thời tiền sử cho đến hiện đại.
Đặc biệt, khu vực mô phỏng cuộc chiến chống Mỹ của chiến khu Đông Triều có thiết kế hết sức tinh tế.
Bên cạnh đó, không gian văn hóa tâm linh tại Quảng Ninh cũng được khắc họa vô cùng sinh động như mô hình chùa Yên Tử, thiền phái Trúc Lâm và di sản nhà Trần tại Đông Triều.
Tầng 3 - Trưng bày lịch sử của ngành than Quảng Ninh
Tầng 3 là không gian ấn tượng dành riêng cho lịch sử hình thành và phát triển của ngành khai thác than nổi tiếng xưa nay của Quảng Ninh.
Khung cảnh lao động trong hầm mỏ được tái hiện qua mô hình mỏ than với hình dáng và kích thước thật để người xem có thể hiểu rõ hơn sự khó nhọc của những người công nhân thầm lặng cống hiến vào nền công nghiệp cho Tổ quốc. Cuối cùng là nơi trưng bày hình ảnh Bác Hồ những lần về thăm Quảng Ninh.