Khi thẩm quyền cấp phép chuyến bay được chuyển về cho Tổ công tác 5 Bộ, cuối tháng 3-2021, Mạnh và Dương tiếp tục đưa cho Hoàng Anh Kiếm 600 nghìn USD chi cho cán bộ Bộ Ngoại giao để xin được cấp phép tổ chức 11 chuyến bay.
Với hành vi này, Hoàng Anh Kiếm bị đề nghị truy tố tội đưa hối lộ, số tiền gần 23 tỉ đồng với vai trò đồng phạm của Mạnh và Dương.
Dù đã nhờ Hoàng Anh Kiếm, Nguyễn Tiến Mạnh và Vũ Thùy Dương vẫn phải chi tiền cho một số cá nhân có thẩm quyền ở cơ quan khác như bị can Vũ Anh Tuấn, cán bộ Cục Quản lý xuất nhập cảnh; bị can Phạm Trung Kiên, Thư ký Thứ trưởng Bộ Y tế.
Ngoài ra, khi sử dụng pháp nhân Công ty Hoàng Long Luxury để xin giấy phép chuyến bay combo, Nguyễn Tiến Mạnh liên hệ và đưa tiền cho nhiều người như cựu Thứ trưởng Bộ Ngoại giao Tô Anh Dũng, cựu Cục trưởng Cục Lãnh sự Nguyễn Thị Hương Lan...
CQĐT đề nghị truy tố Nguyễn Tiến Mạnh tội đưa hối lộ với số tiền hơn 27 tỉ đồng, đề nghị truy tố Vũ Thùy Dương cùng tội danh với số tiền 24,2 tỉ đồng.
Nhóm cá nhân nhận tiền như ông Linh, ông Dũng, bà Lan, ông Kiên… bị đề nghị truy tố tội nhận hối lộ.
Quá trình điều tra, Nguyễn Tiến Mạnh còn chủ động khai báo việc đưa tiền cho một số cá nhân khác. Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an sẽ tiếp tục điều tra, làm rõ và xử lý ở giai đoạn sau của vụ án.
Vụ án được khởi tố tháng 1-2022, liên quan đến nhiều cơ quan như Văn phòng Chính phủ, Bộ Ngoại giao, Bộ Y tế, Bộ Giao thông vận tải, Bộ Công an, Cơ quan đại diện ngoại giao Việt Nam ở nước ngoài…
Cơ quan điều tra đánh giá hành vi phạm tội của các bị can trong vụ án là đặc biệt nghiêm trọng.