Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch cam kết không thay đổi chương trình hay thời gian đào tạo của sinh viên Y Việt Đức các lớp YVĐ2023 và YVĐ2024, đồng hành cho đến khi sinh viên hoàn thành kỳ thi M2 và M3.
Trường Y khoa Phạm Ngọc Thạch lập tổ liêm chính khoa học nhưng toàn là người trong trường, sau đó có hai phó giáo sư xin rút. Chuyên gia khuyến nghị nhà trường mời thành viên độc lập.
Sở Y tế TPHCM đã chấp thuận đơn xin thôi việc của PGS.TS Nguyễn Thanh Hiệp, nguyên Hiệu trưởng Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch, từ ngày 8/9/2025. Trước đó, ông Hiệp từng bị kỷ luật cảnh cáo vì buông lỏng quản lý trong công tác cán bộ.
Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch tiếp tục có công văn khẩn lần 2 gửi Văn phòng Thanh tra Chính phủ, Bộ GD-ĐT, Hội đồng Giáo sư Nhà nước về việc thành lập Hội đồng Giáo sư cơ sở năm 2025.