Theo trang web của Chi cục Thú y vùng VI, lãnh đạo hiện nay gồm có: thạc sĩ Bạch Đức Lữu (Chi Cục trưởng), thạc sĩ Trần Đức Trung và bác sĩ Lý Hoài Vũ (Phó Chi Cục trưởng).
Chi cục Thú y vùng VI được thành lập trên cơ sở hợp nhất và tổ chức lại Trung tâm Thú y vùng TP HCM và Bộ phận Thường trực Cục Thú y tại TP HCM theo Quyết định số 80/2006/QĐ-BNN ngày 18-9-2006 của Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn; tiền thân là Trạm Thú y và Kiểm dịch động vật vùng, Trung tâm Chẩn đoán và kiểm dịch động vật vùng, Trung tâm Thú y vùng TP HCM.
Chi cục Thú y vùng VI thực hiện chức năng quản lý nhà nước về thú y và chẩn đoán, xét nghiệm bệnh động vật, sản phẩm động vật tại vùng được phân công.
Chi cục Thú y vùng VI có tư cách pháp nhân, có con dấu riêng, được hưởng kinh phí từ ngân sách nhà nước, được mở tài khoản theo quy định của pháp luật. Trụ sở của Cơ quan Thú y vùng VI đặt tại TP HCM.
Phạm vi hoạt động của Chi cục Thú y vùng VI gồm các tỉnh, thành phố: TP HCM, Bà Rịa - Vũng Tàu, Đồng Nai, Ninh Thuận, Bình Thuận, Bình Dương, Bình Phước, Tây Ninh, Long An, Tiền Giang và Bến Tre.