Ngày 7/10/2022, bà Trương Mỹ Lan bị khởi tố, bắt tạm giam. Ngày 21, 22/10/2022, ông Trí chỉ đạo trợ lý soạn thảo để ông ký các thủ tục thanh lý hợp đồng chuyển nhượng cổ phần Công ty Văn Lang “khống'', hợp thức ghi lùi ngày, tháng, năm để chiếm đoạt số tiền 1.000 tỉ đồng đã nhận của bà Trương Mỹ Lan.
Vietnamnet dẫn kết luận điều tra cho biết, ban đầu tại cơ quan điều tra, ông Trí phủ nhận việc đã nhận 1.000 tỉ đồng từ bà Lan, phủ nhận quan hệ kinh tế với nữ đại gia. Thậm chí, ông Trí từng khẳng định rằng bà Lan đã vu khống, bôi nhọ danh dự của mình.
Đáng chú ý, khi có kết quả giám định tài liệu xác định chữ viết của ông Trí trong các tài liệu theo dõi và xác nhận số tiền đã nhận từ bà Lan, ông Trí vẫn không thừa nhận hành vi.
Tuy nhiên "lời nói dối" của ông Trí bị cơ quan điều tra đánh giá là thể hiện ý thức chiếm đoạt tài sản của bà Lan đến cùng.
Về phần mình, bà Lan có đơn yêu cầu làm rõ, xử lý hành vi của ông Trí trong việc chiếm đoạt tiền của bà này, đề nghị thu hồi 1.000 tỉ đồng nêu trên để giải quyết theo quy định của pháp luật.
Tuy nhiên, sau đó ông Nguyễn Cao Trí đã khai nhận hành vi phạm tội và khẳng định không biết nguồn gốc số tiền nhận của bà Lan lấy từ đâu.
Sau khi nhận tiền, ông Trí khai sử dụng để mua các loại cổ phần, cổ phiếu, bất động sản, thanh toán cho Dự án Sài Gòn Silicon…
Ông Trí cũng có đơn đề nghị nộp tiền để khắc phục hậu quả.
Cơ quan cảnh sát điều tra cũng đã kê biên, phong tỏa tài sản của ông Trí để đảm bảo thu hồi tài sản cho vụ án.
Theo báo Tiền Phong, hiện cơ quan điều tra đã thu giữ tài sản khi thực hiện khám xét nhà và nơi làm việc của ông Trí hơn 93 tỉ đồng, kê biên 7 bất động sản do vợ chồng ông Trí đứng tên tổng trị giá hơn 266 tỉ đồng.
Ngoài ra, gia đình ông Trí đã nộp hơn 640 tỉ đồng vào tài khoản tạm giữ của cơ quan điều tra để khắc phục hậu quả, tổng số tiền cơ quan điều tra thu giữ là trên 1.001 tỉ đồng.