Trường thực hiện cơ chế tự chủ chi thường xuyên, có tư cách pháp nhân, có tài khoản và con dấu riêng. Quy mô hoạt động giáo dục gồm 36 lớp, trong đó 15 lớp tiểu học, 12 lớp THCS và 9 lớp THPT.
Với việc thành lập trường Tiểu học, THCS và THPT Hồng Đức, Đại học Hồng Đức là đại học công lập trực thuộc UBND tỉnh đầu tiên hoàn thiện cấp đào tạo từ bậc tiểu học đến đại học, sau đại học (thạc sĩ, tiến sĩ).