Công ty Nhật Cường được chọn làm thí điểm việc này. Hơn nữa Công ty Minh Hoa (do vợ ông Chung làm giám đốc) ký hợp đồng kinh tế khống với Công ty Nhật Cường để liên danh Nhật Cường - Đông Kinh hợp thức hóa hồ sơ năng lực dự thầu và trúng thầu.
VKS xác định hành vi của ông Chung xâm phạm hoạt động đúng đắn của cơ quan Nhà nước, làm ảnh hưởng uy tín, hình ảnh của cơ quan công quyền thuộc UBND Hà Nội.
Về hành vi vi phạm quy định đấu thầu, Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư lúc đó là Nguyễn Văn Tứ bị cáo buộc thực hiện theo ý kiến chỉ đạo của ông Chung dừng gói thầu số hoá sai quy định. Ông Tứ sau đó chỉ đạo Nhật Cường làm thí điểm, đưa thêm yêu cầu phải cập nhật hệ thống dữ liệu dùng chung thành phố trong khi thành phố chưa có hệ thống dùng chung để sửa đổi hồ sơ mời thầu. Hành vi này bị cho rằng tạo lợi thế cho liên danh Nhật Cường - Đông Kinh trúng gói thầu năm 2016.
Sai phạm của ông Tứ và các đồng phạm bị xác định gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 26 tỷ đồng. Đây là vụ án có tính chất đồng phạm, các bị can đều trực tiếp thực hiện hành vi phạm tội nên có vai trò tương đương nhau.
Chủ mưu vụ án được xác định là Bùi Quang Huy (Tổng giám đốc Nhật Cường). Tuy nhiên bị can này đang bỏ trốn, cơ quan điều tra đã đình nã và tạm đình chỉ điều tra vụ án, khi nào bắt được sẽ xử lý sau.