Thứ trưởng đề xuất các cơ sở giáo dục đại học hai nước tăng cường triển khai chương trình liên kết đào tạo ở những lĩnh vực mà Thuỵ Sĩ có thế mạnh như du lịch, công nghệ cao... Ngoài ra, hai bên đẩy mạnh hoạt động trao đổi giảng viên, nghiên cứu khoa học, đổi mới sáng tạo. Đại diện các trường đại học hai bên có thể gặp nhau, trao đổi các chương trình hợp tác cụ thể.
Trong nhiều năm qua, Thuỵ Sĩ đã cấp học bổng cho thanh niên Việt Nam hoàn thành chương trình thạc sĩ và tiến sĩ tại Việt Nam. Mỗi năm, trung bình từ một đến ba ứng viên Việt Nam được trao Học bổng Xuất sắc của Chính phủ Thuỵ Sĩ để theo học các chương trình sau tiến sĩ tại nước này.
Từ năm 2020, Quỹ Khoa học Quốc gia Thuỵ Sĩ (SNSF) và đối tác Việt Nam NAFOSTED đã hỗ trợ các dự án nghiên cứu chung của các nhà nghiên cứu Thuỵ Sĩ – Việt Nam. Đợt kêu gọi đề xuất đầu tiên vào tháng 10/2020 đã thu hút 10 đơn đăng ký tài trợ cho các dự án nghiên cứu chung giữa Thuỵ Sĩ và Việt Nam trong nhiều lĩnh vực và chủ đề.