Bên cạnh quy hoạch đô thị, đối với phương án quy hoạch nông thôn, đến năm 2030, quy mô dân số nông thôn khoảng 484.000 người, chiếm khoảng 4,4% dân số toàn thành, được phân bố trong 19 xã.
Đến năm 2030, diện tích lãnh thổ nông thôn của thành phố là khoảng 61.354 ha. Lãnh thổ nông thôn được tổ chức gắn với sản xuất nông nghiệp, nông nghiệp đô thị, sinh thái, bảo tồn Khu dự trữ sinh quyển Cần Giờ; xây dựng nông thôn phát triển toàn diện, bền vững gắn với đô thị hoá.
Hệ thống các điểm dân cư nông thôn đến năm 2030 gồm 19 xã ngoại thành, được quy hoạch, xây dựng, quản lý và phát triển bền vững theo hướng nâng cao chất lượng sống của người dân khu vực nông thôn, giảm tối đa mức độ chênh lệch về trình độ phát triển so với các khu vực đô thị.
Các khu dân cư nông thôn mới được đầu tư, xây dựng và phát triển trở thành các khu dân cư đa chức năng, sinh thái, đáng sống, mật đô thấp, thân thiện với môi trường thiên nhiên, gắn kết giữa sản xuất nông nghiệp với các ngành dịch vụ và du lịch.