Quá trình điều tra mở rộng vụ án, cơ quan điều tra xác định ngày 9/7/2020, Đội Quản lý thị trường số 17 Hà Nội phối hợp Tổ 304 nơi bị ông Trần Hùng làm Tổ trưởng, đã kiểm tra, thu giữ hơn 27.000 quyển sách giả của bị cáo Thuận. Tuy nhiên, vụ việc không được ông Hùng báo cáo với Tổng cục trưởng Quản lý thị trường mà trực tiếp chỉ đạo Cục Quản lý thị trường Hà Nội và đội Quản lý thị trường số 17 kiểm tra, xử lý.
Cáo trạng cho rằng, cá nhân ông Trần Hùng đã nhận 300 triệu đồng của Thuận thông qua người môi giới hối lộ. Sau khi nhận tiền, ông Hùng chỉ đạo cấp dưới tạo điều kiện giúp đỡ Thuận theo hướng xử lý hành chính vụ buôn sách lậu.
Quá trình điều tra, ông Hùng không thừa nhận hành vi, song Viện kiểm sát xác định đủ cơ sở chứng minh ông Hùng đã nhận 300 triệu đồng.
Riêng bị cáo Lê Việt Phương tiếp nhận chỉ đạo của Hùng đã yêu cầu Thành Thị Đông Phương xây dựng hồ sơ, báo cáo để xuất xử lý hành chính vụ việc buôn bán sách giả của Thuận và nhận 310 triệu tiền "cám ơn". Còn Phạm Ngọc Hải được giao nhiệm vụ chủ trì tiêu hủy số sách lậu nhưng đã làm trái công vụ, tự ý trả lại một phần số sách thu giữ và nhận 30 triệu tiền "cám ơn".