Cụ thể, đối với các dự án xây dựng cơ sở hạ tầng để đấu giá đất do UBND TP Tam Điệp (tỉnh Ninh Bình) làm chủ đầu tư, Thanh tra Chính phủ phát hiện có 2 dự án UBND tỉnh Ninh Bình ban hành quyết định thu hồi đất có diện tích lớn hơn so với kế hoạch sử dụng đất.
Đó là dự án quy hoạch khu dân cư mới phường Bắc Sơn (TP Tam Điệp) vượt 2,76ha, dự án khu dân cư mới xã Quang Sơn vượt 8,13ha. Nguyên nhân là khi khảo sát, lập, phê duyệt dự án, chủ đầu tư không tính toán để loại trừ diện tích đất đảm bảo an toàn hành lang lưới điện cao thế chạy qua khu vực dự án, dẫn đến phải điều chỉnh dự án.
UBND TP Tam Điệp phê duyệt quy hoạch chi tiết của 3 dự án xây dựng hạ tầng khu dân cư nằm ngoài khu vực ranh giới đô thị đã được xác định trong bản đồ quy hoạch sử dụng đất. Các dự án vi phạm gồm: hai dự án quy hoạch khu dân cư tại phường Tây Sơn, một dự án khu dân cư tại xã Quang Sơn.
Theo kết luận của Thanh tra Chính phủ, công tác quản lý nguồn thu từ đất nguồn gốc nông trường quốc doanh của tỉnh Ninh Bình trong giai đoạn 2011-2018 cũng có nhiều tồn tại, vi phạm.
Đến thời điểm thanh tra, còn nhiều diện tích đất đã giao cho các công ty sử dụng nhiều năm nhưng chưa ký hợp đồng thuê đất, chưa cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, chưa thực hiện nghĩa vụ tài chính đất đai với Nhà nước, trong đó Công ty CP thực phẩm xuất khẩu Đồng Giao khoảng 1.007ha đất, Công ty CP giống bò thịt sữa Yên Phú là 241,02ha đất, Công ty TNHH MTV Bình Minh 545ha đất, nhưng đều chưa thực hiện nghĩa vụ tài chính đất đai.
Trong giai đoạn 2011-2018, Cục Thuế Ninh Bình cũng thực hiện miễn, giảm tiền thuê đất cho Công ty CP thực phẩm xuất khẩu Đồng Giao, Công ty CP giống vật nuôi và cây trồng Đồng Giao không đúng quy định.