Theo quy hoạch giai đoạn này, Lào Cai sẽ có 2 cặp cửa khẩu quốc tế được mở, nâng cấp là Mường Khương (Lào Cai) – Kiều Đầu (Vân Nam) và Bản Vược (Lào Cai) – Pả Sa (Vân Nam).
Trong 17 lối thông quan/đường chuyên dụng vận chuyển hàng hóa thuộc các cặp cửa khẩu quốc tế, cửa khẩu song phương được mở ở 7 tỉnh, riêng Lào Cai được mở 6 lối thông quan/ đường chuyên dụng vận chuyển hàng hóa.
Đó là các lối Bản Quẩn – Sơn Yêu và Na Lốc - Mã Hoàng Pao, đều thuộc cặp cửa khẩu quốc tế đường bộ Lào Cai (Lào Cai) – Hà Khẩu (Vân Nam); Lũng Pô – Lũng Pô Chải và Y Tý – Ma Ngán Tý thuộc cặp cửa khẩu quốc tế Bản Vược (Lào Cai) – Pả Sa (Vân Nam); Lồ Cồ Chin – Lao Kha thuộc cặp cửa khẩu quốc tế Mường Khương (Lào Cai) – Kiều Đầu (Vân Nam).
Ngoài ra, định hướng của Chính phủ sẽ ưu tiên đầu tư vào các tuyến giao thông liên vùng kết nối đến các cửa khẩu quan trọng, nhất là những cửa khẩu quốc tế trọng điểm đến các trung tâm kinh tế, cảng biển, cảng cạn và thủy nội địa, trục vận tải,... phù hợp với quy hoạch.
Trong đó có tuyến đường cao tốc Hà Nội - Lào Cai; xây dựng tuyến đường sắt Quảng Ninh - Hải Phòng - Hà Nội - Lào Cai, kết nối với Trung Quốc tại cửa khẩu quốc tế đường sắt Lào Cai và đi châu Âu.