Mặt khác, việc giữ nguyên hay tăng học phí theo lộ trình đều được các cơ quan có trách nhiệm đưa ra rất muộn. Hai năm qua, phải đến giữa học kì I, các cơ sở giáo dục ĐH và sinh viên mới biết chủ trương thu học phí như thế nào.
Năm nay, đã gần hết học kì I, trường ĐH vẫn chỉ biết thu tạm mức học phí nào đó, đợi khi có quyết định chính thức rồi tính, gây khó khăn cho sinh viên và hệ lụy là ảnh hưởng đến tâm lí của các gia đình có con em đi học. Theo quy định, các trường đều phải công bố công khai mức học phí khi ban hành đề án tuyển sinh (từ tháng 3 đến tháng 5 hằng năm).
Nghị định số 81/2021/NĐ-CP ngày 27/8/2021 của Chính phủ được ban hành trong bối cảnh đại dịch COVID-19 gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến cuộc sống người dân, vì thế, dù nghị định này đã có hiệu lực nhưng theo yêu cầu của Chính phủ, năm học 2021-2022, các trường ĐH giữ nguyên mức học phí như năm học 2020 - 2021.
Bước sang năm học 2022 - 2023, sau khi các trường đã công bố mức học phí và triển khai thu học phí, ngày 20/12/2022, Chính phủ ban hành Nghị quyết số 165/NQ-CP, yêu cầu các cơ sở giáo dục ĐH công lập giữ ổn định mức thu năm học này bằng với năm học 2021 - 2022. Thực hiện nghị quyết này, hàng loạt trường ĐH đã tăng học phí phải hoàn trả lại cho sinh viên, trong đó có Trường ĐH Y dược Thái Bình.
Đến nay, nhiều trường ĐH vẫn đang băn khoăn về phương án xây dựng mức học phí. Theo lãnh đạo nhiều trường ĐH, quy định học phí cần phải có sớm để tránh tình trạng điều chỉnh, hoàn trả sau khi thu, gây khó khăn cho các trường.