Khi làm hồ sơ tham gia đấu thầu, Lợi chỉ đạo Trần Hậu Nghĩa (được Lợi thuê đứng tên làm Giám đốc Công ty TNHH thiết bị y tế Hải Đăng đồng thời là Phó Giám đốc Công ty Ngọc Đạo) cố tình làm 1 hồ sơ có tiêu chí tốt hơn 2 hồ sơ còn lại, mục đích để một công ty trúng thầu.
Tại Bệnh viện Thủ Đức, Nguyễn Minh Quân thành lập Tổ mua sắm do Ngô Trương Ngọc Bích là Tổ trưởng và Nguyễn Huy Việt là thành viên; Đặng Thị Hiên là Trưởng đơn vị đầu tư dự án.
Hàng năm, Quân ký các quyết định thành lập các tổ thực hiện hoạt động đấu thầu. Thực chất các tổ đấu thầu không hoạt động theo quyết định được phân công, chỉ ký hoàn thiện, hợp thức hồ sơ.
Mặc dù biết rõ các Công ty do Nguyễn Văn Lợi điều hành, quản lý đều là công ty “sân sau” của Nguyễn Minh Quân nhưng theo chỉ đạo của Quân, tổ mua sắm đã thực hiện các hành vi sai phạm.
Kết quả điều tra xác định, từ năm 2016 - 2020, nhóm 4 Công ty do Nguyễn Văn Lợi quản lý đã tham gia đấu thầu và trúng thầu 27/28 gói thầu tại Bệnh viện Thủ Đức, với tổng giá trị hơn 345 tỷ đồng. Cơ quan tố tụng xác định, tổng số tiền lợi nhuận 4 Công ty nêu trên thu được là hơn 102,5 tỉ đồng. Lợi đã chỉ đạo nhân viên chuyển cho vợ chồng Quân, Diễm tổng số hơn 103,6 tỉ đồng và đây là số tiền do nâng khống giá thiết bị y tế từ 27 gói thầu nêu trên
Rửa tiền
Cáo trạng xác định, Nguyễn Minh Quân là người có quyền quyết định cao nhất, có trách nhiệm quản lý tài sản tại Bệnh viện Thủ Đức, đồng thời là chủ và là người điều hành hoạt động của 4 Công ty tham gia đấu thầu để phục vụ việc kinh doanh thuốc, vật tư, trang thiết bị y tế.
Để che giấu số tiền hơn 103,6 tỉ đồng đã chiếm đoạt thông qua hoạt động đấu thầu trái pháp luật, Quân chỉ đạo Nguyễn Văn Lợi mở tài khoản tại Ngân hàng MB chi nhánh Kỳ Đồng, mang tên Lợi nhưng đăng ký số điện thoại của Quân để nhận tiền do các công ty trúng thầu chuyển vào cho Quân sử dụng; Chuyển tiền từ tài khoản của các Công ty trúng thầu vào tài khoản của Công ty Ngọc Đạo, hợp thức thanh toán các hợp đồng mua bán khống, nâng giá máy móc, thiết bị trước khi bán cho Bệnh viện Thủ Đức;
Sử dụng Công ty Nguyễn Tâm đứng tên mua xe ô tô cho Quân sử dụng; Chuyển tiền vào các tài khoản cá nhân của Nguyễn Trần Ngọc Diễm; Chuyển tiền mặt và thanh toán tiền mua bất động sản, xe ô tô cho vợ chồng Quân, Diễm.
Theo cáo trạng, Lợi đã chuyển khoản cho Quân 4 lần, tổng số hơn 21,5 tỉ để sử dụng cá nhân; đưa tiền mặt cho Quân 3 lần, tổng số 5,5 tỉ đồng; và chuyển khoản vào các tài khoản của Diễm hơn 16,1 tỉ đồng; Thanh toán tiền mua bất động sản và ô tô cho vợ chồng Quân, Diễm tổng số hơn 60,4 tỉ đồng,
Cáo trạng nêu rõ, quá trình điều tra, Nguyễn Minh Quân chưa thành khẩn khai báo, đổ lỗi, đùn đẩy trách nhiệm cho cấp dưới, cần xử lý nghiêm để đảm bảo tính răn đe, phòng ngừa chung.