Quá trình đô thị hóa và phát triển đô thị chưa gắn kết chặt chẽ và đồng bộ với quá trình công nghiệp hóa, hiện đại hóa, xây dựng nông thôn mới; kết cấu, chất lượng hạ tầng đô thị chưa đáp ứng được yêu cầu phát triển dân số và kinh tế khu vực đô thị; chưa thích ứng với biến đổi khí hậu và ứng phó với dịch bệnh quy mô lớn. Quy hoạch đô thị chưa kịp thời rà soát điều chỉnh để phù hợp với tình hình phát triển kinh tế - xã hội.
Ngày 27/5/2022, UBND tỉnh đã có công văn thống nhất chủ trương cho phép UBND TX Ninh Hòa lập Đồ án điều chỉnh Quy hoạch chung TX Ninh Hòa đến năm 2040 và vừa được HĐND TX thông qua.
Theo đó, phạm vi quy hoạch là toàn bộ thị xã với 110.795 ha, bao gồm 7 phường và 20 xã. Đến năm 2030, dân số toàn thị xã khoảng 330.000 - 335.000 người; diện tích đất xây dựng đô thị khoảng 5.500 ha - 6.000 ha, bình quân 170-180 m2/người. Đến năm 2040, dân số toàn thị xã khoảng 440.000 - 450.000 người; diện tích đất xây dựng đô thị khoảng 8.000 - 8.500 ha, bình quân khoảng 170 -180m2/người; mỗi xã, phường đều có trạm y tế, trường học…
Lãnh đạo TX Ninh Hòa cho biết, hiện nay, thị xã là đô thị loại IV thuộc tỉnh. Thị xã dự kiến đến năm 2025, tỷ lệ đô thị hóa đạt hơn 65%, đến năm 2030 tỷ lệ đô thị hóa đạt 70%. Đến năm 2030, thị xã phấn đấu đạt tiêu chí đô thị loại III, là đô thị công nghiệp kết hợp cảng biển.
Theo đó, khu vực phía bắc tập trung phát triển công nghiệp ứng dụng công nghệ cao, công nghiệp sạch, logistics phục vụ cho hoạt động luân chuyển hàng hóa của Cảng tổng hợp Nam Vân Phong.
Tuyến cao tốc Khánh Hòa - Buôn Ma Thuột hình thành sẽ thúc đẩy giao thương một lượng hàng hóa lớn từ Tây Nguyên đến Vân Phong và ngược lại, góp vai trò đô thị cửa ngõ, công nghiệp, logistics của TX Ninh Hòa.
Khu vực phía nam Ninh Hòa - vùng ven vịnh Nha Phu phát triển du lịch, liên kết các điểm du lịch hiện có tạo thành một hệ sinh thái du lịch đa chức năng. Thị xã dự kiến có 14/27 đơn vị hành chính là phường (nâng cấp tối thiểu thêm 7 xã thành phường).
Cùng với đó, phát triển không gian TX Ninh Hòa đồng bộ về hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội theo hướng tăng trưởng xanh, trở thành một đô thị biển hiện đại; liên kết vùng Nam Phú Yên - Bắc Khánh Hòa bao gồm ba huyện Nam Phú Yên (Sông Hinh, Đông Hòa, Tây Hòa) và 2 huyện Bắc Khánh Hòa (Vạn Ninh, Ninh Hòa).