Đến ngày 16/8, phiên tòa được mở lại. Trải qua phần xét, Hội đồng xét xử đã quyết định trả hồ sơ để điều tra bổ sung vì cho rằng, các cơ quan tố tụng "cần xem xét lại tội danh" đối với các bị cáo.
Theo hồ sơ điều tra, tháng 4/2019, đoàn thanh tra do Nguyễn Thị Kim Anh làm trưởng đoàn được giao nhiệm vụ thanh tra công tác quy hoạch, quản lý, xây dựng tại một số dự án trên địa bàn UBND huyện Vĩnh Tường (Vĩnh Phúc). Tuy nhiên, nhóm này đã thanh tra ngoài đối tượng, phạm vi theo quyết định của Bộ trưởng Bộ Xây dựng. Trong quá trình thanh tra, nhóm đối tượng bị bắt quả tang nhận tiền để bỏ qua lỗi của doanh nghiệp.
Ngày 12/6/2019, Công an tỉnh Vĩnh Phúc bắt quả tang Nguyễn Thị Kim Anh nhận 68 triệu đồng của kế toán tại UBND xã Tân Tiến, huyện Vĩnh Tường để không giảm trừ khối lượng giá trị của một số hạng mục công trình mà UBND xã Tân Tiến là chủ đầu tư; nhận 91,5 triệu đồng của công chức tài chính kế toán UBND thị trấn Thổ Tang, huyện Vĩnh Tường.
Theo cơ quan điều tra, chỉ sau hơn 1 tháng, nhóm các bị cáo đã chiếm đoạt, thu lợi bất chính hơn 2 tỷ đồng, riêng Nguyễn Thị Kim Anh làm trưởng đoàn chiếm đoạt 1,3 tỷ đồng.
Quá trình điều tra, truy tố xác định 4 bị cáo có liên quan gồm: Nguyễn Thị Kim Anh (sinh năm 1975, cựu Phó Trưởng phòng Phòng chống tham nhũng, thanh tra, Bộ Xây dựng); Đặng Hải Anh (sinh năm 1981, chuyên viên Phòng Thanh tra xây dựng; Nguyễn Thị Kim Liên (sinh năm 1977, cán bộ Phòng Thanh tra xây dựng) và Nguyễn Thùy Linh (sinh năm 1994, cán bộ Phòng Giám sát, kiểm tra và xử lý sau thanh tra).